清洗使用过缓冲盐的高效液相色谱仪色谱柱时最好不要使用100%的水，因为大部分C1s柱并不适合纯水的流动相。

使用磷酸盐鍰冲溶液，尽量避免和乙腈同时使用，因为磷酸盐在乙腈内溶解度很小。如果一定要使用的话，建议预先手动混合而非在线自动混合。

注意高效液相色谱仪不同检测器的出口废液管。因为设计的废液管同时有稳定流通池压力的阻尼作用。所以，废液管不能太短，否则可能引起流通池内压力不稳而造成基线波动。

同时，注意保持废液管的畅通，因为不同流通池耐压不同，VWD40bar,DAD120 bar MWD120 bar FLD20 bar RID Sbar(RID、FLD永远只能是最后一个检测器)，堵塞的废液管可能造成流通池过压而破裂。

定期清洗溶剂过滤头（35%浓硝酸浸泡1小时，不建议使用超声波清洗流动相应经过0.45um或更小孔径的滤器过滤，如果使用滤膜，注意有机膜与水膜的区别。