细胞破碎仪运用广泛，但是在使用时也有一些注意事项。

1 、切记空载，一定要将超声变幅杆插入样品后才能开机。

2、变幅杆（超声探头）入水深度，探头要居中，不要贴壁。超声波是垂直纵波，插入太深不容易形成对流，影响破碎效率。
3、超声参数设置：设置键好仪器工作参数，具体设置见说明书，对于对温度要求比较敏感的样品（比如细菌）一般外面采用冰浴。
渗透压冲击是较温和的一种破碎方法，将细胞放在高渗透压的溶液中（如一定浓度的甘油或蔗糖溶液），由于渗透压的作用，细胞内水分便向外渗出，细胞发生收缩，当达到平衡后，将介质快速稀释，或将细胞转入水或缓冲液中，由于渗透压的突然变化，胞外的水迅速渗入胞内，引起细胞快速膨胀而破裂。